La sede del Museo sorge nel luogo in cui, durante l’assedio, era schierata una delle batterie nemiche. Il percorso museale, diviso in sezioni tematiche, illustra l’assedio della città, i suoi personaggi e l’attività di recupero delle strutture ipogee svoltasi negli ultimi decenni. Si sviluppa su due livelli collegati al sottostante sistema di gallerie di contromina, visitabile in maniera parziale rispetto al suo sviluppo complessivo.